2001年10月23日,杨凡导演携王祖贤、宫泽理惠以及吴彦祖等一众主演联袂出席《游园惊梦》台湾首映晚会;10月25日王祖贤飞赴日本东京出任东京国际电影节评委。同时《游园惊梦》作为特别观摩片在东京国际电影节期间上映,王祖贤出席了该片记者会及放映会。2003年3月21日,齐秦在北京首都体育馆举办春分演唱会,尾声时大屏幕上放出了王祖贤在加拿大拍摄的问候视频。
2003年,制片人、汤臣老板徐枫女士邀请王祖贤主演内地班底影片《美丽上海》,这是王祖贤电影生涯的告别之作,她在其中饰演一位在美国工作的上海大家庭的女儿,职业是电子工程师。